细菌的能量代谢和生化反应的原理如下：
一、细菌的能量代谢
细菌合成细胞组分和获得能量的基质（生物氧化的底物）主要为糖类，通过糖的氧化或酵解释放能量，并以高能磷酸键的形式（ADP、ATP）储存能量。生物体能量代谢的基本生化反应是生物氧化。生物氧化的方式包括加氧、脱氢和脱电子反应，细菌则以脱氢或氢的传递更为常见。
发酵是大多数细菌共有的基本代谢途径，专性厌氧菌产能的惟一途径。反应最终的受氢体为未彻底氧化的中间代谢产物，产生能量远比需氧呼吸少。1分子葡萄糖可生成2分子丙酮酸，产生2分子ATP和2分子NADH+H+。
需氧呼吸将1分子葡萄糖在有氧条件下彻底氧化，生成C02、H2O，并产生38分子ATP。需氧呼吸中，葡萄糖经过糖酵解途径生成丙酮酸，后者脱羧产生乙医“学教育网搜集整理酰辅酶A后进入三羧酸循环彻底氧化。然后将脱出的氢进入电子传递链进行氧化磷酸化，最终以分子氧作为受氢体。需氧菌和兼性厌氧菌进行需氧呼吸。
厌氧呼吸是专性厌氧菌在没有需氧电子传递链和完整的三羧酸循环的条件下，将1分子葡萄糖经厌氧糖酵解只能产生2分子ATP，最终以外源的无机氧化物（C0、SO42-、N0-）3作为受氢体的一类产能效率低的特殊呼吸。
二、细菌生化反应的原理
各种细菌所具有的酶不完全相同，对营养物质的分解能力亦不一致，因而其代谢产物有别，可以利用生化方法来鉴别不同细菌，称为细医“学教育网搜集整理菌的生化反应试验，常见的有糖发酵试验、VP试验、甲基红试验、枸橼酸盐利用试验、吲哚试验、硫化氢试验、尿素酶试验等。
细菌的生化反应用于鉴别细菌，尤其对形态、革兰染色反应和培养特性相同或相似的细菌更为重要。吲哚试验、甲基红试验、VP试验、枸橼酸盐利用试验常用于鉴定肠道杆菌，合称为IMViC试验。例如大肠埃希菌对这四种试验的结果是“+ + - -”，产气肠杆菌则为“- - + +”。
