在上海市防控H7N9疫情中，该研究团队承担着检测收治患者标本中H7N9病毒核酸载量的任务。该团队收集了病人治疗过程中多个时间点的咽拭子、血液、尿液和粪便标本，使用自行设计的荧光定量RT～PCR方法对上述标本中的H7N9流感病毒核酸载量进行检测，并对其中14位患者进行了病毒载量与病情严重程度的相关性分析。结果发现，病症相对较轻的患者经达菲治疗后，咽拭子的病毒载量显著下降并较快转阴；而重症患者，特别是在后期需要依靠人工肺治疗的患者，其咽拭子的病毒核酸载量在达菲治疗过程中呈持续阳性，甚至出现载量进一步升高的现象，有个别患者在达菲抗病毒治疗19天后仍在其咽拭子标本中检测到了H7N9病毒核酸。

为解释上述临床治疗中出现的“不寻常”现象，袁正宏研究团队对患者标本中H7N9禽流感病毒的两个最重要蛋白HA和NA进行基因序列扩增研究和基因多态性分析， 结果发现两例重症病例在抗病毒治疗过程中其体内H7N9毒株的神经氨酸酶（NA）“292位氨基酸”从R（精氨酸）突变为K（赖氨酸）。也就是说，在治疗早期，292位点是R，而治疗后期这一位点却呈现为K.

该实验室运用Q～PCR单核酸多态性分析法进行分析，结果有了更为重大的发现，即病人标本中“292R毒株”竟然出现了逐渐被“292K毒株”取代的过程。该结果强烈提示：这一突变毒株的出现可能与达菲治疗效果不佳有关。该团队联想到“NA R292K”的突变曾出现在季节性H3N2流感病毒上，以后研究证明该病毒对达菲耐药，更为“巧合”的是，在上海地区最早出现的H7N9病毒中也发现存在这一突变，但当时一直不清楚其临床意义。

专家指出，本研究的重大意义在于首次将“NA 292位”氨基酸的“R/K突变”与临床达菲疗效不佳和不良预后联系起来，并表明耐药的基因突变可以在临床抗病毒治疗过程中被诱导产生，即药物“压力”会促使患者体内病毒产生变异突变，从而导致H7N9禽流感病毒呈现耐药趋势。

上海市H7N9禽流感防治专家组组长、微生物学专家闻玉梅院士认为，该研究结果说明，达菲治疗依然对绝大部分患者有效，一旦确诊应尽早治疗，同时提示在达菲治疗前和治疗过程中必须要对病毒载量和耐药“基因位点”进行密切监测，及时调整治疗方案，以提高救治成功率。闻玉梅说，加快新型抗病毒药物研发已经变得十分重要。