在活动的每个签到点，深圳百合医院都设立了免费的医疗保障点，为广大驴友们全程提供医疗保障、医疗救助医学教育网搜|集整理。为了给活动提供更好的医疗保障，百合医院成立了一个由30余名医务人员组成的医疗保障小组，配备了3辆医疗保障车以及一大批药品。

据不完全统计，百合医院在活动过程中共救助了千余名受伤的患者，医疗保障组成员之一的百合医院护士长董主任表示，这次的百公里活动，由于运动量太大，许多驴友都出现了腿抽筋、起水泡、摔伤、中暑等现象，严重的甚至出现晕厥情况，其中，董主任就救助了12名晕厥的驴友。