亚急性至少占2/3病例，其发病与下列因素有关：

　　（一）血流动力学因素

　　亚急性者主要发生于心脏瓣膜病和先天性心血管畸形。赘生物常见部位为，血流从高压腔经过狭窄口到低压腔产生高速射流和湍流的下游、狭窄口外的内膜（如二尖瓣关闭不全的瓣叶心房面、室间隔缺损的间隔右室倾），此可能与该处侧压下降和内膜灌注减少有利于微生物沉积、生长有关。高速射流冲击或大血管腔内膜处可致局部损伤，如二尖瓣反流束面对的左房壁、未闭动脉导管分流束面对的肺动脉壁等处的内皮受损，也易于感染。

　　（二）非细菌性血栓性心内膜炎

　　当内膜的内皮受损暴露其下结缔组织的胶原纤维时，血小板聚集该处形成血小板微血栓和纤维蛋白沉着，成为结节样无菌性赘生物，称非细菌性血栓性心内膜炎，是细菌定居瓣膜表面的重要因素。无菌性赘生物最常见于湍流区，瘢痕处（如感染性心内膜炎后）和心内外因素所致内膜受损区。

　　（三）暂时性菌血疰

　　各种感染或细菌寄居的创伤过程（如手术、器械操作等）常导致暂时性菌血症。口腔组织创伤常致草绿色链球菌菌血症；消化道和泌尿生殖道创伤、感染所致者为肠球菌和革兰阴性杆菌菌血症医`学教育网搜集整理；葡萄球菌菌血症则见于皮肤和远离心脏部位的感染。循环中的细菌如定居于无菌性赘生物上，感染性心内膜炎即可发生。

　　（四）细菌感染无菌性赘生物

　　此取决于：①发生菌血症的频繁程度和循环中细菌的数量，后者与创伤、感染的严重度和寄居皮肤粘膜处细菌的数量有关；②细菌粘附于血小板微血栓和纤维蛋白的能力。草绿色链球菌从口腔进入血流的机会频繁，粘附性强，故为亚急性感染性心内膜炎的首要病因；大肠杆菌粘附性差，虽为常见菌血症，但极少致心内膜炎。