一般在感染后第2～7天，尿道和尿道腺体的急性卡他性化脓性炎使脓性渗出物自尿道口流出，尿道口充血、水肿。男性病变上行蔓延至后尿道及其腺体、前列腺、精囊及附睾；女性则累及尿道旁腺、前庭大腺、子宫颈以至输卵管，引起上述组织器官的化脓性炎。久之，尿道炎性瘢痕形成使尿道狭窄；输卵管炎可导致输卵管伞部粘连、输卵管积脓。病变扩展致盆腔可引起盆腔炎，可继发不育。淋病除发生泌尿生殖系统病变外，还可经血行播散引起身体其他部位病变，如淋菌性结膜炎、淋菌性肝周围炎、淋菌性皮炎等。少数患者淋球菌经血行播散，发生淋菌性败血症，可伴发急性心内膜炎和脑膜炎等。