慢性复发性腮腺炎的原因不很清楚，一般均认为唾液分泌减少及淤滞是重要的因素。严重的急性腮腺炎症发作以后，导致导管上皮粘液化生，唾液中粘液成分增加，是造成唾液淤滞的因素之一。腺内结石、导管口因创伤性炎症致瘢痕狭窄、主导管过细等，都可以造成阻塞部位远端扩张而致唾液淤滞，有人称此为阻塞性腮腺炎（obstructive parotitis）。复发性腮腺炎好发于腮腺的原因被认为是腮腺导管较长、较窄、易于造成唾液淤滞。

复发性腮腺炎患者的粘液脓性唾液作细菌培养，多为绿色链球菌或其他一睦致病力弱的球菌。是否就是这些细菌造成的腮腺感染意见不一，不少学者认为这仅是一种续发征象。