ACL抗体确切的致病机制不清楚，但ACL抗体阳性或持续升高与患者的动静脉血栓形成、血小板减少、反复自发性流产及神经系统损伤为特征的多系统受累的抗磷脂综合征（APS）密切相关。ACL抗体在SLE患者中阳性检出率很高，总阳性率可达70%～80%，IgG型可达50%～60%，IgM型可达40%～50%.ACL抗体阳性SLE患者发生血管炎、溶血性贫血、心脏及中枢神经系统损害的几率明显高于ACL抗体阴性者，ACL抗体阳性的SLE女性患者因血小板凝集功能增强，血栓素增加，更易形成血栓，妊娠时易发生流产。血清及脑脊液中ACL抗体的检测有助于神经精神性狼疮患者的临床诊断。

ACL抗体在RA患者中的阳性率可达33%～49%，幼年型RA患者可达42%～59%，ACL抗体检测是了解疾病进展及是否伴发APS的实验室指标。在急性脑血管病患者中高水平的IgG型ACL抗体是愈后不良的危险信号，ACL抗体水平降低，病情好转；复发性脑梗死患者血清中ACL抗体水平高于原发性脑梗死患者，ACL抗体阳性是脑出血及脑梗死的危险因素。

非自身免疫性疾病患者，ACL抗体阳性者发生反复自然流产的多于ACL抗体阴性者，在ACL抗体阳性的孕妇中，发生胎儿生长迟缓的几率约为15.0%左右，而在ACL抗体阴性孕妇中，胎儿生长迟缓的发生率仅为1.7%左右，ACL抗体与反复自然流产和胎儿发育迟缓有一定相关性。