人类衣原体主要包括：

（一）沙眼衣原体

不仅可致眼部感染，而且可引起生殖泌尿系统感染、性病淋巴肉芽肿以及其他器官疾病。

近年沙眼衣原体的感染率和危害性已超过淋球菌而居性传播疾病之首。

沙眼衣原体有沙眼生物变种、性病淋巴肉芽肿生物变种（LGV）和鼠生物变种等3个生物变种。

1、沙眼：

由沙眼生物亚种A、B、Ba和C血清型引起。主要通过眼-眼或眼-手-眼途径直接或间接密切接触传播。由结膜引起局部炎症。有滤泡增生。

2、包涵体结膜炎：

由沙眼生物亚种B、Ba、D、Da、E、F、G、H、I、Ia、J、K等血清型引起。包括婴儿及成人两类。婴儿通过产道感染，引起泡涵体结膜炎和婴幼儿肺炎医学教育网搜集|整理。

3、泌尿生殖道感染：

主要由沙眼生物亚种D-K血清型引起，是经性接触传播引起的非淋菌性泌尿生殖道感染的主要病原。衣原体感染是男性尿道炎最常见的病因之一。未经治疗者多数转为慢性，周期性加重，或可合并附睾炎、前列腺炎等。在女性可引起尿道炎、宫颈炎、阴道炎、盆腔炎，也可与妇女不孕症有关。衣原体常与淋病奈球菌混合感染，淋病奈球菌对衣原体的繁殖起激活和促进作用。

4、性病淋巴肉芽肿：

由沙眼衣原体LGC生物亚种L血清型引起性病淋巴肉芽肿，主要通过性接触传播。侵犯腹股沟淋巴结，引起化脓性腹股沟淋巴结炎和慢性淋巴肉芽肿为特征的性病，又称第四性病。

主要侵犯淋巴组织，女性以累及会阴、肛门、直肠及盆腔淋巴结多见，男性以累及腹股沟淋巴结为常见，发生化脓性炎症和慢性肉芽肿，有些可形成瘘管。

（二）鹦鹉热衣原体

主要引起鸟类或家禽类感染，由感染该衣原体的鸟类等动物的粪便污染环境，以气溶胶形式传给人。使人类发生上呼吸道感染、肺炎和毒血症。典型临床表现为非典型性肺炎。也有引起心内膜炎的报道。

（三）肺炎衣原体