替代途径又称旁路途径。它与经典途径的不同之处主要是越过C1、C4和C2，直接激活补体C3，然后完成C5～C9的激活过程；参与此途径的血清成分尚有B、D、P、H、I等因子医学`教育网搜集整理。替代途径的激活物主要是细胞壁成分，如内毒素、某些蛋白水解酶、IgG4、IgA聚合物等。替代途径是通过研究C4缺陷而仍保持补体系统活化的患者而发现的。