IBS的诊断往往是凭患者自己的诉说进行诊断，医生检查常查不出什么病来。患者就诊时常诉说腹痛、腹胀、便秘、腹泻、黏液便等症状。但腹痛的感觉因人而异，有些人觉得严重，但同样的症状换作别人可能又没当回事。如果医生问腹痛或腹部不适的具体部位，很多人也常说不清楚，一会这里，一会那里，部位不定，但多数人认为是下腹和左下腹为多。且这种不适多于排便、排气后缓解。腹泻常为少量稀散不成形便，可有排便较急迫或排便不尽感。粪便多带有白色黏液，象鼻涕样，一般并无脓血。部分患者一会腹泻，一会便秘，粪便有时干结，可呈羊粪状，有时稀便。多数人伴有明显的失眠、焦虑、抑郁等神经精神症状。医生在检查时摸肚子，常发现不了什么问题，有时左下腹可触及痉挛的肠管，有压痛。抽血化验也基本正常。

既然这种病检查时一般查不出什么器质性的病变，为什么看病时医生还要建议患者做这样或那样的检查呢，这是因为IBS是功能性的疾病，但一些胃肠道的肿瘤、炎症等器质性的病变也会出现类似的症状，因此医生需要排除这些器质性的疾病才能诊断IBS，特别是患者同时有便血、贫血、体重减轻、腹部包块、结直肠癌家族史或年龄在40岁以上从未做过什么体检的患者。医生建议的检查可能会因人而异，最常见的包括粪潜血试验、血常规、血生化、血沉、C反应蛋白、肿瘤标志物检查、甲状腺功能检查、腹部B超或CT检查、结肠镜或钡灌肠检查、小肠镜或胶囊内镜检查等。

医生诊断IBS主要根据患者的慢性病史，最近3个月内每个月至少有3天出现腹痛或腹部不适，且这种不适多可在排便后症状缓解。根据其是否有排便频率改变（每日次数多或少）或大便性状改变（大便干结、稀便等）分为不同类型，如便秘型、腹泻型、混合型，根据不同类型，医生用药会不一样。