肝功能异常程度取决于慢性病毒性肝炎的病情。轻者ALT略有升高，中度者ALT和AST反复或持续中等度升高，重度患者除ALT和AST反复明显升高外，还有碱性磷酸酶（ALP）、γ-谷氨酰转移酶（GGT）、胆红素不同程度升高，血清白蛋白降低、球蛋白升高、凝血酶原时间延长、凝血因子Ⅱ、Ⅴ、Ⅶ、Ⅸ、Ⅹ减少。迄今尚无一项或一组血清学标志可对肝纤维化进行明确分期。

　　（二）肝炎病毒学检测

　　肝炎病毒血清学及病毒基因检测对慢性病毒性肝炎的诊断以及估价病情和指导治疗有着重要的意义。野生株HBV复制活跃表现为HBeAg阳性、HBVDNA阳性，当前C区变异株复制活跃时则表现为HBeAg阴性、抗-HBe阳性、HBV-DNA阳性。治疗后HBV-DNA和HBeAg阴转，并出现抗-HBe，提示抗病毒治疗有效。抗HBc-IgM阳性提示近期存在乙型肝炎病毒感染。抗HDV-IgM、HDVAG、HDVRNA阳性是诊断重叠丁型肝炎的依据。

　　（三）肝炎病毒的基因型检测

　　HBV及HCV基因分型有助于判断治疗的难易程度及制定抗病毒治疗的个体化方案。HCV的Simmonds分型法应用广泛，分6个基因型及不同亚型，将HBV分为A～H8个基因型，目前多认为A型对干扰素治疗的应答率更高，但尚需要深入的研究加以证实。不同基因型肝炎病毒的地理分布存在着差异。

　　（四）肝穿刺活体组织学检测

　　对经血清病毒学检测尚不能明确诊断者进行肝组织的肝炎病毒基因分析常有助于明确病原学诊断，而且还可对炎症活动度以及纤维化程度进行评价。