强直性脊柱炎与类风湿性关节炎有所不同，它主要侵犯纤维软骨关节，如椎间盘、胸骨柄，耻骨联合与棘间韧带。骶髂关节100％受累，有软骨破坏，腐蚀与软骨下骨皮质硬化，最后纤维化至骨性强直。
　　在关节囊和韧带附着於骨骼处也可以出现局灶性炎性病灶。这些病灶以后也会有反应性纤维化与骨质沉着。还可以有其它关节以外的病灶，如葡萄膜和主动脉根部也可有炎性病变。