在全结肠镜检查后，必须用套扎器或电外科活检钳彻底摘除息肉；对未作肠道准备的患者切勿使用电烙术（切除性套扎或电灼法），因为结肠细菌产生的氢和甲烷有发生爆炸的危险。如果通过结肠镜切除未获成功，应考虑剖腹探查。大的绒毛状腺瘤恶变的可能性很大，必须完全切除。

　　癌性息肉的治疗取决于间变上皮向息肉蒂部的侵入深度，内镜切除界线的最近距离和恶性组织的分化程度。如果恶变上皮局限于粘膜肌层内，息肉蒂部有清楚的切除界线或病变是高分化型的，进行内镜下切除并作严密的内镜随访应该是足够了。浸润穿过粘膜肌层可侵及淋巴管并且淋巴结转移可能性增高。对低分化或那些在息肉蒂部切除界线尚不清楚的病变，则应进行结肠部分切除术。

　　息肉切除后，对其随访检查的时间安排尚有争论。大多数权威人士主张每年2次进行结肠镜全结肠检查（如果不能进行全结肠镜检查则可用钡剂灌肠），并切除新发现的息肉。如果每年一次连续2年检查未发现新的息肉，则以后每2~3年进行一次结肠镜检查。